직장질루의 경우에 비수술적인 치료방법으로는 근치되기 어렵다.

직장질루의 가장 좋은 치료방법은 수술하여 직장질루의 원인이 되는 비정상적인 누관을 제거하여 항문과 질을 정상적인 구조로 만들어 주는 것이다.

복잡한 직장질루의 경우에도 입원없이 수술할 수 있고 수술 후 앉거나 걸을 수 있고 운전하고 집에 갈 수 있다.